Parent Prophet
Nástroj na automatickú kalkuláciu pravdepodobnosti príbuznosti osôb
Program Parent Prophet umožňuje analýzu príbuzenstva vzoriek, ktoré sú spolu s markermi a frekvenciami aliel uložené v oddelenej databáze. Program dokáže presne vyrátať pravdepodobnosť príbuzenstva pre ľubovoľný príbuzenský vzťah pomocou rýchleho inferenčného algoritmu, pričom vzťahy sú modelované pomocou Bayesovskej siete. Program zároveň obsahuje niekoľko preddefinovaných vzorcov (matka+dieťa+potenciálny otec / dieťa+potenciálny otec) na výpočet najbežnejších príbuzenských vzťahov. Modelovanie Bayesovskej siete je umožnené pomocou grafického rozhrania. Program umožňuje efektívnu správu dát a vytvorených analýz uložených v databáze pomocou grafického rozhrania, vyhľadávanie podobných vzoriek na základe genotypu v databáze ( čo može slúžiť napríklad na identifikáciu kontaminácie zamestnancami laboratória ) a taktiež export analýz do excelovských šablón.
Hlavné výhody softvéru Parent Prohet
- Štandardné (matka+dieťa+potenciálny otec / dieťa+potenciálny otec) alebo vlastné analýzy príbuzenstva.
- Rýchly inferenčný algoritmus pre výpočet pravdepodobnosti vlastných analýz.
- Schopnosť importovať genetické markery, frekvencie aliel a vzorky.
- Export reportov do Excelovských šablón.
- Centralizovaná databáza (DB) na zvolenom počítači, možnosť vzdialeného prístupu.
- Vyhľadávanie vzoriek v DB na základe podobnosti genotypov.
- Nastaviteľné používateľské kontá s rôznymi prístupovými právami.
Produkty
- ADICyt na automatizované klastrovanie dát z prietokovej cytometrie
- ADprot na automatizované vyhľadávanie dát v proteínových databázach
- ExProf na zostavovanie a porovnávanie expresných profilov
- InDelFinder na automatizované vyhľadávanie mutácií v sekvenciách DNA
- Logit na automatickú detekciu závislostí v dátach pomocou logistickej regresie
- MultipluginG na pridanie funkcionality k programu Geneious pre potreby NextGen sekvenovania
- Parent Prophet na zisťovanie príbuzenstva ľubovoľných osôb